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新軟件精準(zhǔn)快速識(shí)別和定位蛋白質(zhì)

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TomoTwin軟件克服了許多現(xiàn)有工具的障礙:它學(xué)會(huì)在斷層圖像中挑選形狀相似的分子,并將它們映射到幾何空間。在學(xué)習(xí)過(guò)程中,它將相似的蛋白質(zhì)放置在彼此附近的系統(tǒng)會(huì)得到獎(jiǎng)勵(lì),否則會(huì)受到懲罰。

該軟件為直接在細(xì)胞環(huán)境中自動(dòng)識(shí)別和定位蛋白質(zhì)鋪平了道路,擴(kuò)大了Cryo-ET的潛力。Cryo-ET有可能破譯生物分子在細(xì)胞內(nèi)的工作,并進(jìn)一步揭示生命的基礎(chǔ)和疾病的起源。

在TomoTwin軟件生成的新圖譜中,研究人員可分離并準(zhǔn)確識(shí)別不同的蛋白質(zhì),利用這一點(diǎn)來(lái)定位它們?cè)诩?xì)胞內(nèi)的位置。此外,該軟件的一個(gè)優(yōu)勢(shì)是,通過(guò)取消訓(xùn)練步驟,甚至可在本地計(jì)算機(jī)上運(yùn)行。

目前,該軟件可在細(xì)胞中定位大于15萬(wàn)道爾頓的球狀蛋白質(zhì)或蛋白質(zhì)復(fù)合體。未來(lái),研究團(tuán)隊(duì)的目標(biāo)是定位膜蛋白、絲狀蛋白和較小尺寸的蛋白。

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